Длительный процесс исторического развития территории, контрастность современных ландшафтов обусловили высокое разнообразие растительного сообщества на территории республики. Растительные ресурсы республики насчитывают более 2 тысяч видов растений, из них 200 видов растений-эндемиков, встречаются только в горах Алтая. Тут произрастают свыше 40 видов плодово-ягодных растений, отличающихся хорошими вкусовыми качествами, высоким вхождением витаминов, бактерицидными свойствами, к тому же многие виды являются ценными лекарственными растениями. Возле 100 видов растений входят в группу лекарственных, используемых в фармацевтической промышленности, но в народной медицине сей перечень значительно шире. Многие реликтовые растения и растения-эндемики занесены в Красную Книгу. Лесные ресурсы республики сосредоточены на площади возле 43 тыс.кв.км. и оцениваются в 700 млн. куб.м., в том числе 600 млн.куб.м. хвойных пород.

Животный вселенная Республики Алтай представлен 80 видами млекопитающих, 300 видами птиц (из которых возле 250 гнездящихся), 44 видами рыб, 7 видами пресмыкающихся, 2 видами земноводных и внушительный группой беспозвоночных животных. В Красную книгу Республики Алтай занесены 72 вида животных. Алтай является одним из основных охотничьих центров Западной Сибири. Охотничья фауна тут насчитывает 34 вида млекопитающих и 29 видов птиц.